北京大学审计室成立于1985年6月，是学校设立的负责全校内部审计工作的职能部门，内设财务审计、管理审计、工程审计三个办公室。

　　《北京大学章程》规定：“学校建立内部审计制度，设立审计机构，在校长领导下依法独立行使审计职权，对学校及所属机构的业务活动、内部控制进行审计，对各内部组织机构负责人经济责任进行审计”。

　　北京大学内部审计专业化、职业化建设处于行业领先水平。截至2019年底，审计人员中具有高级职称的有5人，具有中国注册会计师（CPA）资格的有3人，具有法律职业资格的2人，具有国际注册内部审计师（CIA）资格的达到12人，具有经济、管理类研究生学历的达到90％以上。此外，还有注册造价师等专业人才。

　　北京大学审计室连续多次被审计署评为全国内部审计先进集体。